Да, можете заключить контракт по пункту 5 части 1 статьи 93 Закона № 44-ФЗ с физлицом на покупку б/у запчасти. Закон № 44-ФЗ разрешает покупать б/у товары. Не указан перечень сопроводительных документов по качеству для данных товаров. В контракте не пишите документы, которые не сможет предоставить физлицо. Обязательно укажите, что товар является бывшим в употреблении и принадлежал физлицу. Так как физлица без статуса ИП не могут заниматься перепродажей товаров в силу налогового законодательства. Есть только возможность продавать свое имущество. Вы можете самостоятельно запросить сертификат на запчасть у официальных представителей/производителя и приложить к контракту либо найти в интернете, при возможности.
Также в контракте нужно уточнить размер налоговых платежей при продаже имущества. Обычный порядок по пункту 2 части 13 статьи 34 Закона № 44-ФЗ тут не действует.
Физические лица самостоятельно уплачивают налог исходя из сумм, которые получили от продажи имущества, принадлежащего этим лицам на праве собственности, и имущественных прав. Об этом сказано в статье 228 НК.
Оснований вычитать из общей суммы НДФЛ, пенсионные отчисления и отчисления на ОМС нет. Физлицо не оказывает вам услуги, а продает свой б/у товар. Начислять все эти виды платежей нет оснований. Уточните данный вопрос в налоговых органах для правильного формирования текста контракта.