С 1 октября 2022 года поставщики обязаны формировать электронные счета-фактуры в ЕИС. Налоговая служба подготовила разъяснения, как применять правила системы прослеживания при формировании электронных документов. Это письмо ФНС № ЕА-4-15/6374@ от 25.05.2022

Как выставлять счета-фактуры
Для всех товаров, которые подлежат прослеживаемости, первичные и корректировочные счета-фактуры надо выставлять только в электронной форме через операторов электронного документооборота (п. 1.1 ст. 169 НК РФ). Это правило применяется и для тендеров в рамках Закона № 44-ФЗ. Ранее можно было формировать и передавать счета-фактуры и УПД через операторов электронного документооборота по ТКС (Приказ Минфина № 14н от 05.02.2021).
С октября выставление электронных счетов-фактур через Единую информационную систему обязательным для всех поставщиков. Оператором электронного документооборота при выставлении документов в Единой информационной системе выступает Федеральное казначейство (ч. 6 ст. 4 44-ФЗ, ПП РФ № 442 от 13.04.2017).

Как работать поставщикам с НДС
Если участники оборота товаров являются плательщиками НДС или относятся к налогоплательщикам на специальных режимах, освобожденным от обязанности платить налог, они оформляют электронный УПД — универсальный передаточный документ (пп. «г» п. 13 Положения о НСПТ из ПП РФ № 1108 от 01.07.2021). Если же меняется стоимость из-за новой цены или количества отгруженных товаров — универсальный корректировочный документ в электронной форме. Такой же порядок действует для участников товарного оборота на спецрежимах, если они проводят реализацию или передачу товаров в собственность на безвозмездной основе (письмо ФНС № ЕА-4-15/6374@ от 25.05.2022).